RESUMO
The presence of crpP was established in 201 Pseudomonas aeruginosa isolates from 9 Peruvian hospitals. The 76.6% (154/201) of the isolates presented the crpP gene. Overall, 123/201 (61.2%) isolates were non-susceptible to ciprofloxacin. The prevalence of crpP-possessing P. aeruginosa in Peru is higher than in other geographical areas.
RESUMO
Introduction: In Peru, on 11 February 2023, the Ministry of Health registered 4 million patients infected with COVID-19 and around 219,260 deaths. In 2020, the SARS-CoV-2 virus was acquiring mutations that impacted the properties of transmissibility, infectivity, and immune evasion, leading to new lineages. In the present study, the frequency of COVID-19 variants was determined during 2021 and 2022 in patients treated in the AUNA healthcare network. Methods: The methodology used to detect mutations and identify variants was the Allplex™ SARS-CoV-2 Variants Assay I, II, and VII kit RT-PCR. The frequency of variants was presented by epidemiological weeks. Results: In total, 544 positive samples were evaluated, where the Delta, Omicron, and Gamma variants were identified. The Delta variant was found in 242 (44.5%) patients between epidemiological weeks 39 and 52 in 2021. In the case of Gamma, it was observed in 8 (1.5%) patients at weeks 39, 41, 43, 45, and 46 of 2021. The Omicron variant was the most frequent with 289 (53.1%) patients during weeks 49 to 52 of 2021 and 1 to 22 of 2022. During weeks 1 through 22 of 2022, it was possible to discriminate between BA. 1 (n = 32) and BA.2 (n = 82). Conclusion: The rapid identification of COVID-19 variants through the RT-PCR methodology contributes to timely epidemiological surveillance, as well as appropriate patient management.
Assuntos
COVID-19 , SARS-CoV-2 , Humanos , SARS-CoV-2/genética , COVID-19/epidemiologia , Peru/epidemiologia , Reação em Cadeia da Polimerase em Tempo Real , Teste para COVID-19RESUMO
The aim of the study was to determine the frequency of six genes encoding serine protease autotransporter proteins Enterobacteriaceae (SPATE) in diffusely adherent Escherichia coli (DAEC) isolates from children with (WD, n=63) and without diarrhea (WOD, n=41) from Lima, Peru. WOD were considered a control group. For the detection of the genes, 2 multiple PCRs were standardized: triple A (sigA, pet, espP) and triple B (sat, pic, espC). In both groups, the most frequent SPATE gene was Sat (39.7% of WD and 41.5% of WOD), followed by spP (20.6% and 9.7% in WD and WOD respectively). The other genes were detected in proportions lower than 10.0%, in the following order of frequency: pet, sigA, espC and pic, without significant differences between the groups. It was concluded that Sat is the most frequent SPATE in DAEC and that these strains may possess SPATE genes regardless of whether they are isolated in WD or WOD.
El objetivo del estudio fue determinar la frecuencia de seis genes que codifican proteínas autotransportadoras serin-proteasa de Enterobacteriaceae (SPATE) en aislamientos de Escherichia coli difusamente adherente (DAEC) provenientes de niños con diarrea (NCD, n=63) y sin diarrea (NSD, n=41) de Lima, Perú. Los NSD se consideraron como grupo control. Para la detección de los genes se estandarizaron 2 PCRs múltiples: triple A (sigA, pet, espP) y triple B (sat, pic, espC). En ambos grupos el gen SPATE más frecuente fue sat (39,7% de NCD y 41,5% de NSD), seguido de espP (20,6% y 9,7% en NCD y NSD respectivamente). Los otros genes se detectaron en proporciones inferiores al 10,0%, en el siguiente orden de frecuencia: pet, sigA, espC y pic, sin diferencias significativas entre los grupos. Se concluye que Sat es la SPATE más frecuente en cepas DAEC, y que estas cepas pueden poseer genes SPATE independientemente de si se aíslan en NCD o NSD.
Assuntos
Toxinas Bacterianas , Infecções por Escherichia coli , Proteínas de Escherichia coli , Criança , Diarreia , Enterobacteriaceae , Escherichia coli/genética , Proteínas de Escherichia coli/genética , Humanos , Peru , Serina Proteases/genética , Sistemas de Secreção Tipo VRESUMO
RESUMEN El objetivo del estudio fue determinar la frecuencia de seis genes que codifican proteínas autotransportadoras serin-proteasa de Enterobacteriaceae (SPATE) en aislamientos de Escherichia coli difusamente adherente (DAEC) provenientes de niños con diarrea (NCD, n=63) y sin diarrea (NSD, n=41) de Lima, Perú. Los NSD se consideraron como grupo control. Para la detección de los genes se estandarizaron 2 PCRs múltiples: triple A (sigA, pet, espP) y triple B (sat, pic, espC). En ambos grupos el gen SPATE más frecuente fue sat (39,7% de NCD y 41,5% de NSD), seguido de espP (20,6% y 9,7% en NCD y NSD respectivamente). Los otros genes se detectaron en proporciones inferiores al 10,0%, en el siguiente orden de frecuencia: pet, sigA, espC y pic, sin diferencias significativas entre los grupos. Se concluye que Sat es la SPATE más frecuente en cepas DAEC, y que estas cepas pueden poseer genes SPATE independientemente de si se aíslan en NCD o NSD.
ABSTRACT The aim of the study was to determine the frequency of six genes encoding serine protease autotransporter proteins Enterobacteriaceae (SPATE) in diffusely adherent Escherichia coli (DAEC) isolates from children with (WD, n=63) and without diarrhea (WOD, n=41) from Lima, Peru. WOD were considered a control group. For the detection of the genes, 2 multiple PCRs were standardized: triple A (sigA, pet, espP) and triple B (sat, pic, espC). In both groups, the most frequent SPATE gene was Sat (39.7% of WD and 41.5% of WOD), followed by spP (20.6% and 9.7% in WD and WOD respectively). The other genes were detected in proportions lower than 10.0%, in the following order of frequency: pet, sigA, espC and pic, without significant differences between the groups. It was concluded that Sat is the most frequent SPATE in DAEC and that these strains may possess SPATE genes regardless of whether they are isolated in WD or WOD.
Assuntos
Humanos , Masculino , Feminino , Lactente , Pré-Escolar , Criança , Diarreia Infantil , Enterobacteriaceae , Escherichia coli , Fatores de Virulência , Genes , InfecçõesRESUMO
RESUMEN El objetivo del estudio fue determinar la frecuencia de seis genes que codifican proteínas autotransportadoras serin-proteasa de Enterobacteriaceae (SPATE) en aislamientos de Escherichia coli difusamente adherente (DAEC) provenientes de niños con diarrea (NCD, n=63) y sin diarrea (NSD, n=41) de Lima, Perú. Los NSD se consideraron como grupo control. Para la detección de los genes se estandarizaron 2 PCRs múltiples: triple A (sigA, pet, espP) y triple B (sat, pic, espC). En ambos grupos el gen SPATE más frecuente fue sat (39,7% de NCD y 41,5% de NSD), seguido de espP (20,6% y 9,7% en NCD y NSD respectivamente). Los otros genes se detectaron en proporciones inferiores al 10,0%, en el siguiente orden de frecuencia: pet, sigA, espC y pic, sin diferencias significativas entre los grupos. Se concluye que Sat es la SPATE más frecuente en cepas DAEC, y que estas cepas pueden poseer genes SPATE independientemente de si se aíslan en NCD o NSD.
ABSTRACT The aim of the study was to determine the frequency of six genes encoding serine protease autotransporter proteins Enterobacteriaceae (SPATE) in diffusely adherent Escherichia coli (DAEC) isolates from children with (WD, n=63) and without diarrhea (WOD, n=41) from Lima, Peru. WOD were considered a control group. For the detection of the genes, 2 multiple PCRs were standardized: triple A (sigA, pet, espP) and triple B (sat, pic, espC). In both groups, the most frequent SPATE gene was Sat (39.7% of WD and 41.5% of WOD), followed by spP (20.6% and 9.7% in WD and WOD respectively). The other genes were detected in proportions lower than 10.0%, in the following order of frequency: pet, sigA, espC and pic, without significant differences between the groups. It was concluded that Sat is the most frequent SPATE in DAEC and that these strains may possess SPATE genes regardless of whether they are isolated in WD or WOD.
Assuntos
Humanos , Masculino , Feminino , Pré-Escolar , Diarreia , Escherichia coli , Infecções Bacterianas , Fatores de Virulência , GenesRESUMO
Introduction: Cervical cancer is a public health problem. Objective: To determine the level of knowledge about prevention and risk factors for cervical cancer in women of a technical institute in the city of Cali, Colombia. Methods: Cross-sectional study with the participation of 131 women enrolled in any of the academic programs of the educational institution, to whom a structured survey was applied. Results: The general average of positive answers was 51.7%. The correct knowledge on prevention was calculated in 86.1%, while the knowledge of risk factors was estimated in 34.6%. Conclusions: We found a high level of knowledge regarding cytology and the vaccine against human papillomavirus in questions of preventive methods, but the knowledge on risk factors for the development of cervical cancer was low. These deficiencies could be related to low socioeconomic and academic levels in the population studied.
Introducción. El cáncer de cuello uterino es un importante problema de salud pública. Objetivo. Determinar el grado de conocimiento sobre prevención y factores de riesgo para cáncer de cuello uterino en mujeres de un instituto de educación técnica de la ciudad de Cali, Colombia. Métodos. Estudio de corte transversal, con la participación de 131 mujeres matriculadas en cualquiera de los programas académicos de la institución educativa, a quienes se les aplicó una encuesta estructurada. Resultados. El promedio general de respuestas positivas fue 51,7%. La media de acierto de las variables de conocimiento sobre prevención se calculó en 86,1%, mientras que el promedio de acierto de las variables sobre factores de riesgo se estimó en 34,6%. Conclusiones. Se encontró un nivel de conocimiento alto respecto a la citología y la vacuna contra el virus del papiloma humano como métodos de prevención, pero el nivel fue bajo cuando se consideraron los factores de riesgo para el desarrollo de cáncer de cuello uterino. Estas deficiencias podrían estar relacionadas con nivel socioeconómico y académico bajos en la población estudiada.
RESUMO
OBJECTIVE.: The objective of this study was to describe the presence of Enterobacteriaceae in meat samples collected in traditional markets of Lima and to establish the levels of antimicrobial resistance and the presence of extended spectrum beta-lactamases (BLEE) and AmpC in Escherichia coli. MATERIALS AND METHODS.: A total of 138 meat samples, 64 (46.4%) chicken, 44 (31.9%) beef and 30 (21.7%) pork were collected. The isolated bacteria belonged to 17 different genera and, specifically, 14 were classified as Enterobacteriaceae. Sensitivity to ten antimicrobial agents was analyzed using the Kirby-Bauer disc diffusion method, BLEE and AmpC were determined by double disc and imipenem-ceftazidime induction tests, respectively. RESULTS.: Antimicrobial resistance levels were high against trimethoprim-sulfamethoxazole, ampicillin, tetracycline, nalidixic acid, ciprofloxacin and chloramphenicol. There are significant differences in antibiotic resistance levels depending on the type of meat (chicken, beef and pork) (p <0.05). Multiple drug resistance (MDR) levels were particularly high in chicken and pork (98.2% and 86.4%, respectively). In addition, the presence of BLEE in Escherichia coli isolated from chicken meat was 59.4%. CONCLUSIONS.: Multiple drug resistance levels were high compared to antibiotics frequently used in humans; chicken and beef are highlighted as potential reservoirs of BLEE and pAmpC-producing Escherichia coli, respectively.
OBJETIVOS.: El objetivo del presente estudio fue describir la presencia de Enterobacteriaceae en muestras de carne recolectadas en mercados tradicionales de Lima y establecer los niveles de resistencia a antimicrobianos y la presencia de betalactamasas de espectro extendido (BLEE) y AmpC en Escherichia coli. MATERIALES Y MÉTODOS.: Se recolectaron un total de 138 muestras de carne, 64 (46,4 %) de pollo, 44 (31,9 %) de carne de res y 30 (21,7%) de carne de cerdo. Las bacterias aisladas pertenecieron a 17 géneros diferentes, y específicamente 14 fueron clasificados como Enterobacteriaceae. Se analizó la sensibilidad frente a diez agentes antimicrobianos mediante el método de difusión de disco Kirby-Bauer, se determinó la presencia de BLEE y AmpC mediante las pruebas de doble disco y de inducción de imipenem-ceftazidima, respectivamente. RESULTADOS.: Los niveles de resistencia a los antimicrobianos fueron altos frente a trimetoprima-sulfametoxazol, ampicilina, tetraciclina, ácido nalidíxico, ciprofloxacino y cloranfenicol. Existen diferencias significativas en los niveles de resistencia a los antibióticos según el tipo de carne (pollo, carne de res y cerdo) (p <0,05). Los niveles de resistencia a múltiples antimicrobianos (MDR) fueron particularmente altos en pollo y cerdo (98,2 % y 86,4 %, respectivamente). Además, la presencia de BLEE en Escherichia coli aisladas de carne de pollo fue del 59,4 %. CONCLUSIONES.: Los niveles de resistencia a los antimicrobianos fueron altos frente a los antibióticos usados frecuentemente en humanos, se destaca el pollo y la res como potenciales reservorios de Escherichia coli productoras de BLEE y pAmpC, respectivamente.
Assuntos
Farmacorresistência Bacteriana Múltipla , Enterobacteriaceae/efeitos dos fármacos , Microbiologia de Alimentos , Carne/microbiologia , Proteínas de Bactérias , Estudos Transversais , Farmacorresistência Bacteriana Múltipla/genética , Enterobacteriaceae/genética , Enterobacteriaceae/isolamento & purificação , Escherichia coli/efeitos dos fármacos , Escherichia coli/genética , Escherichia coli/isolamento & purificação , Indústria Alimentícia , Peru , Estudos Prospectivos , Resistência beta-Lactâmica , beta-LactamasesRESUMO
RESUMEN Objetivos. El objetivo del presente estudio fue describir la presencia de Enterobacteriaceae en muestras de carne recolectadas en mercados tradicionales de Lima y establecer los niveles de resistencia a antimicrobianos y la presencia de betalactamasas de espectro extendido (BLEE) y AmpC en Escherichia coli. Materiales y métodos. Se recolectaron un total de 138 muestras de carne, 64 (46,4 %) de pollo, 44 (31,9 %) de carne de res y 30 (21,7%) de carne de cerdo. Las bacterias aisladas pertenecieron a 17 géneros diferentes, y específicamente 14 fueron clasificados como Enterobacteriaceae. Se analizó la sensibilidad frente a diez agentes antimicrobianos mediante el método de difusión de disco Kirby-Bauer, se determinó la presencia de BLEE y AmpC mediante las pruebas de doble disco y de inducción de imipenem-ceftazidima, respectivamente. Resultados. Los niveles de resistencia a los antimicrobianos fueron altos frente a trimetoprima-sulfametoxazol, ampicilina, tetraciclina, ácido nalidíxico, ciprofloxacino y cloranfenicol. Existen diferencias significativas en los niveles de resistencia a los antibióticos según el tipo de carne (pollo, carne de res y cerdo) (p <0,05). Los niveles de resistencia a múltiples antimicrobianos (MDR) fueron particularmente altos en pollo y cerdo (98,2 % y 86,4 %, respectivamente). Además, la presencia de BLEE en Escherichia coli aisladas de carne de pollo fue del 59,4 %. Conclusiones. Los niveles de resistencia a los antimicrobianos fueron altos frente a los antibióticos usados frecuentemente en humanos, se destaca el pollo y la res como potenciales reservorios de Escherichia coli productoras de BLEE y pAmpC, respectivamente.
ABSTRACT Objective. The objective of this study was to describe the presence of Enterobacteriaceae in meat samples collected in traditional markets of Lima and to establish the levels of antimicrobial resistance and the presence of extended spectrum beta-lactamases (BLEE) and AmpC in Escherichia coli. Materials and Methods. A total of 138 meat samples, 64 (46.4%) chicken, 44 (31.9%) beef and 30 (21.7%) pork were collected. The isolated bacteria belonged to 17 different genera and, specifically, 14 were classified as Enterobacteriaceae. Sensitivity to ten antimicrobial agents was analyzed using the Kirby-Bauer disc diffusion method, BLEE and AmpC were determined by double disc and imipenem-ceftazidime induction tests, respectively. Results. Antimicrobial resistance levels were high against trimethoprim-sulfamethoxazole, ampicillin, tetracycline, nalidixic acid, ciprofloxacin and chloramphenicol. There are significant differences in antibiotic resistance levels depending on the type of meat (chicken, beef and pork) (p <0.05). Multiple drug resistance (MDR) levels were particularly high in chicken and pork (98.2% and 86.4%, respectively). In addition, the presence of BLEE in Escherichia coli isolated from chicken meat was 59.4%. Conclusions. Multiple drug resistance levels were high compared to antibiotics frequently used in humans; chicken and beef are highlighted as potential reservoirs of BLEE and pAmpC-producing Escherichia coli, respectively.
Assuntos
Farmacorresistência Bacteriana Múltipla , Enterobacteriaceae/efeitos dos fármacos , Microbiologia de Alimentos , Carne/microbiologia , Peru , Proteínas de Bactérias , beta-Lactamases , Indústria Alimentícia , Estudos Transversais , Estudos Prospectivos , Resistência beta-Lactâmica , Farmacorresistência Bacteriana Múltipla/genética , Enterobacteriaceae/isolamento & purificação , Enterobacteriaceae/genética , Escherichia coli/isolamento & purificação , Escherichia coli/efeitos dos fármacos , Escherichia coli/genéticaRESUMO
Los Trastornos temporomandibulares (TTM) son un grupo de patologías que afectan a la articulación temporomandibular (ATM) y la musculatura masticatoria. En la interpretación musical, se realizan movimientos repetitivos o posiciones forzadas de la mandíbula que pueden desencadenar TTM. El ojetivo del presente trabajo fue determinar la prevalencia de TTM en una población de estudiantes de música en una institución universitaria de Cali. Se empleó el cuestionario y examen clínico. "Criterios diagnósticos para la investigación de los Trastornos Temporomandibulares" (CDI/TTM). Se realizaron pruebas inter-evaluadores para medir el nivel de concordancia de los evaluadores con el experto, se empleó el coeficiente de correlación de concordancia de Lin (CCC), teniendo como resultado un grado de concordancia sustancial. Se evaluaron 81 (n=81) estudiantes, 79 % de sexo masculino y 21 % de sexo femenino, con edad promedio de 26,3 años, los síntomas más frecuentes fueron: acufenos con el 71,60 %, click en la ATM 49,38 %, dolor orofacial 45,68 % y bruxismo con el 35,80 %; siendo uno de las más representativos en los estudiantes que utilizan instrumentos de viento. El signo articular más frecuente fue apertura con desviación 30,86 %, sonidos articulares en ATM derecha 20,99 %. Mayor prevalencia de sintomatología en estudiantes de decimo semestre. La prevalencia de signos y síntomas de TTM es muy frecuente, es de vital importancia realizar la detección temprana de TTM para evitar alteraciones que impidan continuar con su ejercicio profesional.
The temporomandibular disorders (TMD) are a group of pathologies which affect the temporomandibular joint (TMJ) and the masticatory muscles. In the musical performance, repetitive movements or forced mandibular positions are realized, which can trigger TMD. To determine the prevalence of TMD in a population of music students from a university in Cali. It was used the survey and clinical test "Research Diagnostic Criteria for temporomandibular disorders (RDC/TMD)". Inter-rater tests were applied for measuring the consistency level between evaluators and expert. Lin's Concordance Correlation Coefficient (CCC) was implemented, having as a result a substantial matching. 81 (n=81) students were evaluated, 79 % male and 21 % female with an average age of 26.3 years. The most common symptoms were: tinnitus with 71.60 %, clicking in the TMJ with 49.38 %, orofacial pain with 45.68 %, and bruxism with 35.80 % being one of the most representative disorders in students who use wind instruments. The most common articular signs were opening with deviation 30.86 % and articular clicking in the right TMJ 20.99 %. The most prevalent symptomatology was found in 10th semester students. the prevalence of TMD signs and symptoms is very frequent, it is really important to realize an early detection of TMD to prevent alterations that do not allow to continue with a professional performance.
